Kalifer och patriarker: Efter att regeringens centrum flyttat från Damaskus till Bagdad, blev den nestorianska "katoliken" prestigefylld på grund av det stora antalet anhängare i Irak, Persien och bortom österut. Han valdes av sin kyrka, och kalifen ratificerade hans val och skrev ett förbund för honom precis som han brukade skriva till stora arbetare. Endast en text återstår av dessa förbund, utfärdade av kalifen Al-Mustanjed år 1139. Han skrev också till den jakobitiska patriarken och den romerske patriarken. Nubiska kristna hade, till skillnad från alla andra kristna, en utmärkt position i den islamiska staten. De betalade skatt till sin kung, och skatter administrerades av honom i islamiska länder.

Judarna hade en president i Bagdad som hette "Ras al-Jalut", och en annan president i Kairo efter upprättandet av den fatimida staten, som kallades "Sarhasarim", vilket betyder prinsens furste. Detta utnämnde de judiska rabbinerna i Egypten och Levanten. En av de jakobitiska patriarkerna protesterade och sa i ett råd med kalifen: Magiernas och judarnas ledare är världsliga härskare, och att han är en andlig president som bara kan utdöma andligt straff, som att besluta att avsätta en biskop, avskuren en präst, eller hindra en lekman från att delta i kyrkans högtider.

Våra patriarkers tillhörighet till den universella kyrkan, deras anslutning till det grekiska språket och deras fäste vid dess kyrkliga etikett förblev en anledning till att anklaga dem för att luta sig mot romarna, spionera på dem och läsa muslimska nyheter. De förblev långt ifrån sin store kollega, patriarken av Konstantinopel, och kommunicerade inte med honom och vågade inte nämna honom i Dhabikha. Det nämndes i Eutychius historia under årets nyheter (937-938) att romarna och muslimerna ingick vapenvila och bytte fångar, så Theophylactus, patriark av Konstantinopel, skickade en budbärare till Eutychius själv, patriark av Alexandria, för att Theodosius, patriark av Antiokia, och till Chrysotelus, patriark av Jerusalem, och frågade dem: "Kommer de att nämna hans namn i sina böner och mässor?" Detta hade upphört vid tiden för det umayyadiska kalifatet.”

Theodore (774-797) var oense med kyrkan i Konstantinopel och dess kejsare, och fortsatte att respektera ikoner, halshögg huvudstaden av Hama eftersom han stod på Konstantinopels sida i frågan om ikoner tvingades utstå exilens och förföljelsens plåga när Konstantin V invaderade kalifatets gränser och deporterades till Moab.
Job I, patriark av Antiokia (813-844), hade sitt hjärta inriktat på att samarbeta med kaliferna för att släppa anklagelser och väcka misstankar, så han krönte den upproriske Thomas av Sicilien inför kejsar Michael II för att behaga Al-Ma'mun . Han följde med Al-Mu'tasim till belägringen av Ankara, där han talade med dess garnison "på rumänska och sa: 'Lyd sultanen och hyllas', men han möttes av förolämpningar och stenar." Christophoros, patriark av Antiochia (960-967), bestämde sig för att flytta från Antiokia under kriget mellan Sayf al-Dawla och romarna, så han gick till Simeonklostret och bodde där. När romarna återvände till sitt land åkte Christophoros till Sayf al-Dawla i Aleppo, och han tog emot honom väl och tackade honom för vad han hade gjort. Patriarken återvände till Antiokia. Sedan dog Sayf al-Dawla, och allmänheten vände sig mot Christophoros, och hans vän Ibn Manik anklagade honom för att skriva till romarna och agitera dem. "Så patriarken svor att han aldrig hade skrivit till romarna, men några av khorasanierna hoppade på honom, och en av dem fick honom att resa sig upp, och en annan slog honom med en dolk och högg honom i magen, och han föll, och hans huvud höggs av och kastades i en badugn, och hans kropp bars och kastades i floden. Innan morgonen skickade Ibn Manak en grupp människor in i Qassyan-kyrkan. De beslagtog det de hittade i patriarkens hus och i kyrkans skattkammare det i huset till en sheik känd som Ibn Omar. Han blev kvar i sitt hem tills romarna tog kontroll över staden. Åtta dagar senare dök patriarkens kropp upp på flodön, och en grupp kristna kom ut, tog den i hemlighet och begravde den i klostret som kallas Ersana utanför staden.

Hierarki i Antiokia: Hänvisningarna skiljer sig åt när det gäller arvsföljden av patriarker och deras efterföljd i det apostoliska ämbetet, och deras åsikter skiljer sig åt när det gäller att bestämma ämbetstiden för var och en av dem. Här är vad som stod i listan över Konstantius av Konstantinopel, vad som nedtecknades av Eutychius, patriarken av Alexandria, och vad som skrevs efter honom av Yahya Ibn Saeed, en appendix till Eutychios historia.

Det är uppenbart från den revidering som gjordes på 900-talet av patriarken Anastasius av Antiokia att de ortodoxa troende vid den tiden föredrog att samlas vid kusterna snarare än att sprida sig inåt landet, och att de viktigaste kuststiften i Antiochian See blev i tionde århundradet enligt följande:

1. Akka stift Från Carmel River till Zeeb River, inklusive det libanesiska klostret Saint George.
2. Tires stift Från Zebfloden till Litanifloden.
3. Sidon stift Från Litani till Damour.
4. Beirut stift Från Damourfloden till Ibrahimfloden. Till det är tornet Trieris och tornet Christ Gigarta.
5. Byblos stift Från floden Abraham till strömmen Kanonit.
6. Batrouns stift Från denna ström fram till ytan av stenen Lithoprosopon.
7. Tripoli stift Från huvudet på stenens ansikte (Al-Shaq'a) till Sir Strothion.
8. Artouz stift Ortosier från Sylstrothion till Chrysopotamos.
9. Arqa stift Från Christopotamos till Sousie River (fortet).
10. Tartous stift Från Susiyafloden till Marqiafloden. Det kallades Hentargos stift.
11. Baniyas stift Från Marqiyafloden till Baniyasfloden. Det är föremål för Metropolitan of Abameya.
12. Stadens socken Paltos från Banias River till Great River. Hon är självständig.
13. Stiftet Jableh Från den stora floden till floden Zion.
14. Latakia stift Från Zion River Bridge till Thrascaia River.
15. Apamia stift Från Traskifloden till Great River (Orontes).
16. slaviskt stift Från den stora floden till Keropotamos, inklusive klostret Saint Simeon.
17. Mopsousta stift Från Keropotamos till Great Pisi River.
18. Adana stift Fram till Rhososfloden, som är gränsen mellan Antiokia och Konstantinopels två ser.

Samma reviderade lista hänvisar till två katoliker som är anslutna till Antiochiska sessan, en av dem katoliker från Romangyris och den andra katoliker i Irenoupolis. Fader Vailhe förklarade att Warmagiris är stadsdelen Rum i Nishapur och att Irinopolis är fredens stad, det vill säga Bagdad. Anledningen till prästvigningen av de första katolikerna var det stora antalet grekiska köpmän i Nishapur. När det gäller Bagdad var det abbasidernas huvudstad och inkluderade ett betydande antal medlemmar av den universella kyrkan. Det nämndes i Ibn al-Abris historia att patriarken av Antiochia, Elias Sam, var den första ortodoxa katoliken i Bagdad. år 910.