L'Église se forme et apparaît dans l'établissement du mystère de l'action de grâce divine et de notre participation à celle-ci, car c'est le secret qui transforme la communauté, c'est-à-dire la paroisse, en église. Dans le mystère de l'action de grâce divine, la paroisse devient une Église universelle, parce que le Christ lui-même y est présent. Les croyants doivent savoir que chaque fois qu’ils se rassemblent pour accomplir la liturgie divine, « leur Église se rassemble », c’est-à-dire toute l’Église. Chaque membre de la paroisse est membre de l'Église orthodoxe universelle.

La naissance supérieure dont parle le Christ est « la purification de la seconde naissance et le renouveau venant du Saint-Esprit », c'est-à-dire la réception du Saint-Esprit par le baptême qui a lieu au nom de la Sainte Trinité. C'est la présence du Saint-Esprit qui renouvelle la naissance de l'homme. Cette présence s'effectue au sein de l'Église à travers le sacrement du baptême et d'autres sacrements

Le Saint-Esprit n’est pas étranger à la nature du Père, car il vient de son essence, ce qui signifie que les deux sont d’une seule essence. L’homme ne peut pas atteindre cette vérité seul. Il doit être guidé par le Saint-Esprit lui-même, et nous ne pouvons pas lui fixer de limites, ni le séparer du Père et du Fils.