Det blev anført i munken Edessas historie, at det tredje råd i Antiokia forbød Manis lære, samtidig med at det forbød Paulus af Samesatas lære. Dette er et svagt udsagn, der ikke kan tages i betragtning, fordi historikeren Al-Rahawi registrerede dets oplysninger i det trettende århundrede. Det stod også i nogle syriske historier og i Michael den Stores historie, "at Mani blev født i byen Sus i år 240 og blev kristen, og dens biskop ordinerede ham til præst i år 268, så han afslog kristendommen på grund af hans naturs ondskab." Denne udtalelse er også svag, fordi den kom sent.
Michael den Store blev født i år 1126 i Malatya og døde i år 1199! Forskere og gravemaskiner er enige om, at Mani Ibn Babak blev født i Mardin i år 215 og 216, og at han gjorde krav på åbenbaring for første gang, da han var tretten år gammel, derefter femogtyve, det vil sige i år 240 og 240. Mani underviste og prædikede i Ctesiphon og fremhævede Shapur for et af hans breve. Han sagde, at der er to grundlæggende årsager: lys og mørke og tre forhold: fortid, nutid og fremtid. Ifølge Mani er lys og mørke to uafhængige væsener adskilt fra evigheden. Men mørket erobrede lys i fortiden, og noget lys blev blandet med mørke. Dette er tilstanden i vores verden på nuværende tidspunkt. Så afslutter Mani med at sige, at lyset skal renses fra dette mørke, for at lyset og mørket kan vende tilbage til den fuldstændige adskillelse, som de begyndte. Gud er herre over lysets verden, og Satan er herre over mørkets verden. Her er noget af det, Mane sagde om fortiden. Hvad nutiden angår, sendte lysets kræfter Buddha og Roaster, derefter Jesus, som er den vigtigste af alle. Ifølge Mani ender verden i fremtiden med en massiv opstandelse og et stort fald, hvor de retfærdige stiger opad i rummet, og de ugudelige falder ned i permanent mørke. Mani fremhævede Herren Frelseren i en fremragende position og hævdede, at han er hans sendebud, og at han er Parakleten - Trøsteren - Helligånden - som Mesteren lovede, og at hans evne til at vide, hvad der var og hvad der vil være, er afledt. fra Parakleten, der boede i ham. De specialister, der var i stand til at studere de resterende breve fra Mani i Turkestan og papyruspapirerne i Egypten, mener, at manikæismen forgrenede sig fra kristendommen, ikke hedendommen.
Manikeerne var organiseret i en enkelt kirke bestående af to klasser: de udvalgte og tilhørerne. I spidsen stod først og fremmest tolv apostle, derefter tres disciple, derefter biskopper, præster, diakoner og munke. De samledes hver søndag for at bede, synge og læse bøger, inklusive evangelierne og apostlen Paulus' breve. Manis lære spredte sig først i Babylon og Mesopotamien, derefter Syrien, Palæstina, Egypten, Nordafrika, Persien og Centralasien. Shapur I forblev tavs om ham på grund af hans åbne sind og brede horisonter. Men præsterne i Mizda modstod denne lære, så Mani blev tvunget til at forlade Persien til Kashmir, Turkestan og Kina. Shapur døde i år 272, og hans søn Hormizd I døde og efterfulgte ham i år 273. Bahram I overtog tronen, så manikæerne troede, at deres lærer ville være i stand til at vende tilbage til sit hjemland og leve i sikkerhed og frihed. Men han blev arresteret, korsfæstet, flået og proppet med halm i årene 275 og 276.
